Trabalho de Conclusão de Curso

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https://repositorio.ifmg.edu.br/handle/20.500.14387/678

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Navegando Trabalho de Conclusão de Curso por Assunto "Microbioma"

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    Análise comparativa do microbioma de leite bovino de amostras individuais e de tanque de expansão refrigerado em rebanhos produtores do Queijo Minas Artesanal Canastra
    (2025-02-03) Oliveira, Evelly de Souza; Doutor Raphael Steinberg da Silva; Doutor Gustavo Augusto Lacorte
    O leite bovino é uma matriz biológica rica e complexa, cuja microbiota exerce influência direta na qualidade dos produtos finais de sua cadeia produtiva e na saúde da glândula mamária. No contexto da produção do Queijo Minas Artesanal Canastra, a microbiota do leite é particularmente relevante, pois contribui tanto para as características sensoriais do queijo quanto para a manutenção da qualidade microbiológica da matéria-prima. O entendimento dessa microbiota é essencial para otimizar processos produtivos, garantir a segurança alimentar e desenvolver estratégias de controle de enfermidades, como a mastite, que afeta diretamente a qualidade do leite. Neste estudo, investigou-se o microbioma do leite bovino em rebanhos produtores do Queijo Minas Artesanal Canastra. Foram analisadas 94 amostras individuais de leite e 6 amostras de tanque de expansão refrigerado, totalizando 100 amostras provenientes de 6 fazendas da região. A identificação bacteriana foi realizada utilizando-se a técnica de sequenciamento do gene 16S rRNA. Os filos predominantes foram Actinobactéria, Proteobacteria, Firmicutes e Bacteroides, com destaque para as classes Actinobactéria, Gammaproteobacteria, Clostridia e Alphaproteobacteria. Entre as bactérias do ácido lático (BAL), observaram-se maiores frequências dos gêneros Streptococcus (77%), Enterococcus (9%), Lactococcus (5%), Aerococcus (3%) e Lactobacillus (2%). Corynebacteriaceae e Sphingomonaceae foram as famílias mais frequentes nos heatmaps das fazendas, enquanto, nos tanques de expansão refrigerado, as maiores frequências foram Corynebacteriaceae, Sphingomonaceae, Micrococcaceae e Moraxellaceae. A Análise das Coordenadas Principais (PCoA) revelou uma notável similaridade entre as amostras, independentemente da fazenda de origem ou do armazenamento no tanque. A ausência de agrupamentos distintos nos gráficos de PCoA sugere que fatores como proximidade geográfica e condições de manejo similares favorecem uma microbiota homogênea, sem alterações significativas ao longo do processo. Os resultados contribuem para uma melhor compreensão das comunidades microbianas no leite bovino e suas interações, bem como auxiliam no desenvolvimento de práticas voltadas à melhoria da saúde animal e da qualidade do leite. Além disso, os achados fornecem subsídios para estratégias baseadas no microbioma que promovam a sustentabilidade e a valorização da cadeia produtiva do Queijo Minas Artesanal Canastra.
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    Montagem de ambiente de análises ecológicas de microbiomas usando a Plataforma Qiime2
    (2020-08-30) Willian Mendes Gonçalves; Doutor Gustavo Augusto Lacorte
    A Bioinformática é uma área interdisciplinar que integra conhecimentos de diversas áreas, como Ciências Biológicas, Ciência da Computação, Estatística, entre outras. Há um debate em torno da necessidade de biólogos tornarem-se proficientes em programação, levando em consideração a complexidade e o tempo necessário para especializar-se nessa área. Embora essa exigência seja questionável, o conhecimento básico na área pode facilitar a comunicação entre biólogos e especialistas em computação, especialmente em situações em que programas prontos não atendem a necessidades específicas. Diante desse cenário, este Trabalho de Conclusão de Curso visou realizar uma avaliação de diferentes estratégias de montagem de ambiente de uso da plataforma Qiime 2, para análises metataxonômicas. Para validar o ambiente e a pipeline, foram analisados dados de sequenciamento de amplicons, provenientes do Parque Nacional da Serra da Canastra, focando em áreas impactadas e não impactadas pelo fogo, durante o um Manejo do Fogo Integrado. Ao final das analises, foi possível identificar como a ação do fogo mudou as comunidades microbiológicas do solo. A análise comparativa de máquinas para bioinformática revelou que, embora computadores com menor disponibilidade de recursos sejam capazes de executar processos básicos, tarefas mais complexas, especialmente em estudos de microbiomas, exigem máquinas com maior disponibilidade de recursos. Nos testes realizados, a máquina com 64 GB de RAM e 12 vCPUs demonstrou ser a mais adequada para lidar com grandes volumes de dados e processos intensivos. No entanto, para pesquisas com restrições orçamentárias, uma abordagem mais econômica e eficiente pode ser a combinação estratégica de diferentes máquinas, permitindo a otimização de custos sem comprometer a qualidade dos resultados.