As doenças respiratórias em equinos representam um desafio clínico devido à diversidade de agentes etiológicos e à complexidade do diagnóstico. Entre essas enfermidades, infecções fúngicas são raras, porém de difícil manejo, exigindo abordagens terapêuticas específicas e acompanhamento prolongado. O trabalho objetivou relatar um caso de suspeita de granuloma fúngico em uma égua da raça Mangalarga Marchador, atendida no Campus do IFMG, em Bambuí. O animal, de oito anos e meio, apresentava histórico de secreção nasal serossanguinolenta, disfagia, dificuldade respiratória e lesões hiperêmicas na mucosa nasal e região da glote. Apesar de terapias anteriores com antimicrobianos e anti-inflamatórios, os sinais persistiram. Durante o exame físico, identificaram-se lesões ulcerativas e granulomatosas, indicando suspeita de granuloma fúngico. O tratamento incluiu fluconazol manipulado, com ajustes de dosagem ao longo do período. Houve melhora parcial nas lesões da mucosa nasal e redução do edema, mas o animal permaneceu com secreção nasal e perdeu condição corporal. A evolução clínica foi monitorada por 90 dias, mas, apesar dos esforços terapêuticos, o animal veio a óbito de forma súbita, sem necropsia para confirmar a causa do falecimento. Discussões diagnósticas consideraram abscessos bacterianos, neoplasias, pitiose e pneumonia como diferenciais, mas o diagnóstico conclusivo de granuloma fúngico foi limitado pela ausência de exames complementares, como cultura fúngica ou PCR. O caso destaca a complexidade do diagnóstico e manejo de doenças respiratórias em equinos, reforçando a necessidade de exames complementares e terapias individualizadas. Além disso, evidencia os desafios na resposta ao tratamento antifúngico, corroborando com literatura que sugere a necessidade de longo acompanhamento e intervenções adaptativas.